Description du poste
Le CHUV recrute un-e assistant-e universitaire en génétique. Une opportunité passionnante dans un environnement de recherche dynamique.TâchesAnalyser des données de séquençage pour la recherche et le diagnostic.Collaborer avec biologistes et cliniciens pour interpréter les résultats.Participer à des expériences de biologie cellulaire et génétique.CompétencesDoctorat en génétique moléculaire ou équivalent requis.Compétences en séquençage et analyse de données NGS souhaitées.Maîtrise des techniques de biologie cellulaire et moléculaire.RecherchePremier-ère assistant-e universitaire ou chargé-e de recherche en génétiqueLe Service de médecine génétique recherche un-e premier-ère assistant-e universitaire ou un-e chargé-e de recherche, à un taux d’activité de 80% à 100%, pour une entrée en fonction au 1er février 2026 dans le cadre d’un contrat à durée déterminée d’une année.ContexteLe Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) est l'un des 5 hôpitaux universitaires suisses. Grâce à sa collaboration avec la Faculté de biologie et médecine de l'Université de Lausanne et l'EPFL, le CHUV joue un rôle de pointe dans les domaines des soins médicaux, de la recherche médicale et de la formation.Le service de médecine génétique du CHUV est composé d’une unité clinique et de laboratoires de diagnostic moléculaire et chromosomique. L’unité clinique comprend 3 médecins cadres, 3 cheffes de clinique, 3 assistants, 4 conseillers en génétique et 1 psychologue. Plus de 5000 patients sont vus en consultations par an (neurogénétique, oncogénétique, cardiogénétique, néphrogénétique, etc…).Les laboratoires de diagnostic moléculaire et chromosomique comprennent 4 biologistes FAMH, 6 experts scientifiques, 1 bio-informaticien et 10 techniciens de laboratoire. Plus de 2500 analyses sont réalisées par an à partir de méthodes variées (caryotype, FISH, array CGH, Sanger, MLPA, NGS, etc…). Certains patient-e-s bénéficient d’un séquençage short read après capture exome et d’une analyse Mendéliome en trio.Vous rejoindrez une équipe de recherche nouvellement constituée. Les projets portent sur les patients suivis dans le service de Médecine Génétique et pour lesquels aucun diagnostic moléculaire n’a pu être posé malgré de multiples analyses. Nous travaillons à l’identification de nouveaux gènes responsables de maladies monogéniques rares puis sur la compréhension des mécanismes physio-pathologiques expliquant ces dysfonctionnements par des validations fonctionnelles variées (organoïdes, modèles in vivo). Nous nous intéressons, en particulier, aux gènes responsables de troubles du neurodéveloppement d’une part et d’ataxie monogénique d’autre part.Des collaborations avec des équipes de recherche de l’Université de Lausanne et de l’EPFL sont envisagées.MissionVous analysez des données de séquençage de génomes short reads et long reads dans le cadre des activités de recherche (80%) ainsi que dans un contexte diagnostique (20%)Vous contribuez à l’intégration et à l’interprétation des résultats en collaboration étroite avec les biologistes, cliniciens et bio-informaticiens du serviceVous participez à la réalisation d’expériences de génétique moléculaire, incluant notamment l’extraction d’ADN/ARN, le séquençage Sanger et la qPCRVous prenez part à des expériences de biologie cellulaire telles que la culture cellulaire, la transfection ou encore l’édition du génomeVous participez à la conception, à la rédaction et à la rédaction de projets de recherche en réponse à des appels d’offresVous contribuez à la rédaction de publications scientifiques et à la valorisation des résultatsVous assurez une veille scientifique et technologique régulière concernant les nouvelles méthodes et approches d’analyse génomiqueVous contribuez à l’encadrement et à la formation d’étudiants impliqués dans les projets de recherche.ProfilVous êtes titulaire d’un doctorat en génétique moléculaire ou d’un diplôme équivalent reconnuVous possédez des compétences dans le domaine du séquençage de 2ᵉ génération (NGS), incluant la maîtrise des techniques, l’évaluation des indicateurs de qualité, l’interprétation des données de séquençage d’exomes et/ou génomes dans le domaine des maladies rares, ainsi que l’optimisation des protocoles et la résolution de problèmes expérimentauxVous maîtrisez les techniques de génétique moléculaire et de biologie cellulaire, et vous êtes capable de les appliquer de manière autonome et rigoureuseVous parlez et écrivez couramment le français et l’anglaisVous disposez de connaissances en langages de programmation tels que Python et R, ainsi que d’expérience dans les pipelines d’analyse NGS (BWA, GATK, SAMtools, bcftools, VEP/ANNOVAR), ce qui constitue un atout pour le posteVous faites preuve de rigueur, d’autonomie et d’un excellent esprit d’équipe, et vous êtes capable de travailler sur des projets interdisciplinairesVous démontrez une grande capacité d’adaptation, de créativité et d’organisation, ainsi qu’une aptitude à gérer efficacement votre ...